Avogadro - 분자모형 편집기

화학부분을 가르칠 때 규격화된 분자 모형을 가지고 분자들의 모양을 만들다보면 분자들 사이의 인력이나 척력을 고려하지 않고 분자모형을 만들 때가 많습니다. 과학선생님들이 유용하게 사용할 수 있는 프로그램을 하나 소개하려고 합니다. 그 프로그램의 이름이 Avogadro입니다.

Avogadro는 제가 개인적으로 좋아하는 화학자입니다. 이 프로그램을 제작하신 분도 아보가드로를 좋아하는 것 같다는 생각이 듭니다.

Avogadro 프로그램은 분자모형 편집기로 굉장히 강력한 기능을 가지고 있습니다. Windows컴퓨터 뿐만 아니라 리눅스, 맥 컴퓨터에서도 작동될 수 있는 프로그램이며, GPL라이센스를 사용하는 공개소프트웨어입니다. 분자를 구성하는 원자들을 배치를 해주면 그 원자들 사이의 인력과 척력을 계산해서 자동으로 모양을 만들어 주기도 합니다. 제가 알지 못하는 화학 용어들이 있어 100% 활용을 하고 있지는 못하지만 아이들에게 분자모형을 역동적으로 보여줄 수 있는 유용한 도구입니다. 과학선생님이라면 꼭 활용해 보시길 바랍니다. 사용방법은 Avogadro홈페이지에서 Documentation wiki를 참고하시면서 따라해 보시면 쉽게 분자모형을 만드실 수 있을 것입니다.

Avogadro 홈페이지 : http://avogadro.cc

참고하실 수 있도록 제가 만들어 본 샘플 그림을 올려봅니다.

아래는 벤젠의 모형입니다.

아래는 메테인의 모형입니다.

아보가드로에서는 분자를 구성하는 원자들의 배치를 자동으로 배치할 수 있고, 분자를 구성하는 원자들 사이의 거리와 각도도 자동으로 계산할 수 있습니다. 아래는 물을 구성하는 산소와 수소 사이의 거리와 각도가 표시된 예입니다.

[새길]

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